爱尔兰的科技管理是按部门行业划分。政府各部负责管理与各自部门业务相关的科技事务。

　　在科技管理方面，企业贸易就业部（Department of Enterprise, Trade and Employment）主要负责国家宏观科技政策的制订，通过下属科技管理机构（如爱尔兰企业局和爱尔兰科学基金会）对公共和大学研究机构以及企业的研究与开发提供资金支持、指导和协调。2005年爱尔兰联合政府改组，迈克尔·马丁担任企业贸易就业部的部长。2007年共和党取得大选胜利，马丁继续担任企贸部部长，主管跨部门科技创新委员会。

　　教育科学部（Department of Education and Science）主要通过下属的管理机构（如高等教育局）为大学的基础研究提供资金支持。现任教育与科学部长由玛丽·哈纳芬担任。

　　为了确立国家科技发展优先领域，制定长期科技发展战略，更好地执行国家科技投入计划，近年来爱尔兰政府不断完善科技创新管理体系，先后组建了如下负责科技管理和政策制订的组织机构：

　　科学技术与创新内阁委员会（Cabinet Committee on Science，Technology and Innovation）

　　2005年8月，爱尔兰政府成立科学技术与创新内阁委员会，由政府总理主管。成员包括政府副总理、企业贸易就业部部长、财政部长、教育科学部部长、卫生与儿童部部长、农业食品部长、通讯能源与自然资源部部长以及环境与地方政府部部长。

　　科学技术与创新内阁委员会将得到跨部门科技创新委员会的辅助，全面负责政府的科技发展工作。其职责是为国家科技创新确定综合发展计划，对科技体制进行审查。确保政府处于高效决策状态，推动总体目标的具体实施。

　　跨部门科学技术与创新委员会（Inter-Departmental Committee on Science and Technologyand Innovation）

　　跨部门科学技术委员会由企业贸易就业部部长主管，成员由各部负责科技事务的高层官员组成。该委员会负责确定各政府部门和科技管理机构科技投入优先领域，审核年度科技投入计划。在此基础上向科学技术与创新内阁委员会提出科技投入的建议。

　　政府首席科学顾问（Chief Science Adviser）

　　2004年6月，爱尔兰政府宣布设置首席科学顾问的职位。首席科学顾问将按照政府的要求，就科技与创新提供独立的专家建议。尤其在欧盟和国际科技问题方面发挥特别的咨询作用。他的另一个关键作用是对独立评估科技政策及规划的体系进行监督。首席科学顾问的办公室设在国家企业贸易科技与创新政策咨询委员会内。

　　第一任首席科学顾问是巴里·麦克斯威尼（Barry McSweeney）博士。但他因被揭发从不法机构美国太平洋西部大学得到博士学位证书而离职。此后首席科学顾问一职就一直空缺。2007年1月，都柏林大学圣三一学院的动物遗传学专家帕特里克·坎宁安（Patrick Cunningham）教授开始正式出任爱尔兰政府首席科学顾问。该项任命于2006年12月19日经政府内阁会议批准，由爱企业贸易就业部正式对外宣布。

　　科技办公室（Office of Science and Technology）

　　科技办公室是企业贸易就业部的职能部门。负责政府整体科技创新政策的制订、科技发展和协调工作；拟订科技预算，包括欧盟资助、研究与开发的投入等；就科技政策相关问题与欧盟、尤里卡计划、欧洲航天局和其它国际科技组织建立联系，协调和推动合作；向主管部长和所属机构就总体科技情况提供咨询和建议。

　　国家企业贸易科技与创新政策咨询委员会（Forfás）

　　国家企业贸易科技和创新政策咨询委员会成立于1994年1月1日，是半官方咨询机构，隶属于企业贸易就业部。Forfás是该机构的爱尔兰语简写。

　　Forfás虽然从企业贸易就业部得到经费，并由主管科技事务的部长负责，但是其研究和咨询的范围不仅限于企业贸易部，而是横向覆盖政府各个部门，负责国家整体的企业和科技发展政策的研究和咨询工作。

　　Forfás与以下7家机构有隶属或密切合作关系：

　　l爱尔兰工业发展署（Industrial Development Agency）

　　l爱尔兰企业局（Enterprise Ireland）

　　l爱尔兰科学基金会（Science Foundation Ireland）

　　l国家资格认证委员会（The National Accreditation Board）

　　l国家竞争力理事会（The National Competitiveness Council）

　　l爱尔兰科学技术与创新理事会（The Irish Council for Science, Technology and Innovation）

　　l爱尔兰未来技能需求专家组（The Expert Group on Future Skills Needs）

　　爱尔兰工业发展署（IDA）

　　爱尔兰工业发展署（简称IDA）隶属于企业贸易就业部，是爱尔兰吸引外商投资的重要半官方机构，主要负责吸引海外投资者到爱尔兰办企业和开展国际服务业，鼓励已在爱投资的外国企业扩大经营规模。该机构已在上海设立了办事机构。

　　爱尔兰企业局（Enterprise Ireland）

　　爱尔兰企业局成立于1998年7月，隶属于企业贸易就业部，是半官方机构。负责推动和管理企业贸易和科技发展。它的服务对象主要是爱尔兰本土企业和部分在爱尔兰经营食品及自然资源的外国企业。同时，它还接受国家和欧盟委托，致力于提高爱尔兰企业技术创新能力，加强爱尔兰企业与高等教育机构的合作。

　　目前，爱尔兰企业局在爱全国各地设有11家办事处，在世界主要国家和地区设有33家办事机构。在中国北京、上海、广州和香港设有办事机构。

　　爱尔兰科学基金会（SFI）

　　2000年3月，爱政府成立爱尔兰科学基金会，通过引进国际顶级研究人员到爱尔兰从事研究工作，推动和发展生物技术和信息通信技术（ICT）的基础研究和应用研究

　　爱尔兰科学基金会起初下属于（Forfás），2003年7月正式确定独立法人地位。首任总干事是美籍科学家威廉·哈里斯（William Harris）博士，他于2006年6月离任。今年2月12日，爱尔兰科学基金会（SFI）董事会宣布，弗兰克·甘农（Frank Gannon）教授被选举为该机构的新任总干事。

　　2002年和2005年，爱尔兰科学基金会分别与中国科技部和国家自然科学基金委员会签定合作协议。在信息通信技术、生物技术和新材料三个领域开展合作研究。

　　科学顾问理事会（ASC）

　　5月18日，爱企贸就业部长马丁宣布成立新的科学顾问理事会（ASC），代替原先的爱尔兰科技创新理事会（ICSTI）。科学顾问理事会在加强协调和制订科技创新政策方面发挥重要作用。

　　原爱尔兰科技创新理事会（ICSTI）成立于1997年，是独立的咨询机构，在负责科技事务的部长领导下和国家企贸科技与创新政策咨询委员会（Forfás）的支持下，就制订科技政策和科技发展战略向政府提供独立的专家级建议。其范围涵盖科学研究、高等教育、产业研究与开发、金融行业创新、科技知识普及、以及国家科技投入的优先领域等。

　　理事会的观点是跨部门科学技术委员会的重要决策依据。每年该机构都向政府提供一系列咨询报告，作为政府制定科技创新政策和计划的重要参考。

　　高等教育局（Higher Education Authority）

　　高等教育局是教育科学部下属机构之一，属于独立的行政事业管理单位。负责规划与发展爱尔兰的高等教育和科学研究工作，向政府提供高等教育的咨询建议。此外，它是高等院校科研的拨款和资金管理机构。